夏日的一天，红发女孩玛丽（杉咲花 配(pèi )音）被送到阿姨夏洛特所在的乡间小(xiǎo )屋度假。初来乍到，玛丽对周遭的一(yī )切还不那么适应，特别是调皮男孩彼(bǐ )得（神木隆之介 配音）有意和她对着干，令玛丽实在高兴不起来。偶然一次的林间探险，玛丽见到了传说中的魔法之花“夜间飞行”，还找到了一柄破扫帚(zhǒu )。偏偏这把魔法扫帚载着玛丽飞上天空，来到了专门(mén )培养魔(mó )法师的恩德学园。在这个神奇的所(suǒ )在，玛丽受到曼布勒切克女士（天海佑希 配音）的殷勤接待，还邂(xiè )逅了怪模怪样的D博士（小日向文世 配(pèi )音）。虽然女孩懵懵懂懂成为了魔法学员，可是他很快(kuài )发现了这里所隐藏的秘密……　　本片根据改编自玛(mǎ )丽(lì )·斯图(tú )尔特的英国儿童文学小说改编，是米林宏昌离开吉卜力工作室后制作拍(pāi )摄的第一部动画长片。